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永祿11年(1568年)9月,織田信長擁護足利義昭上洛,途中又受到了美濃齋藤氏、北近江淺井氏、南近江六角氏等勢力的支持,在織田信長、淺井長政等警護下進軍京都。中途六角氏由於有力支族箕作氏的叛亂而撤退,在父親足利義晴所建的桑實寺駐紮,順利到達京都。三好三人眾退出京都。10月18日朝廷封足利義昭為征夷大將軍,同時敘從四位下參議兼左近衛權中將的官位。就任將軍的義昭下令將對暗殺義輝持縱容態度、慫恿天皇封足利義榮為將軍的近衛前久流放,並讓二條晴良復任關白之職。義昭又將自己的偏諱授予管領細川昭元、畠山昭高,以及關白家的二條昭實,試圖鞏固自己的統治,掌握了兄長義輝所擁有的山城國御料所。同時在山城國設置守護,令三淵藤英據守伏見城。在政務上,義昭同兄長義輝一樣,任命攝津晴門為政所執事,任命飯尾昭連、松田藤弘等為奉公眾,再興幕府。之前因反叛義輝而被滅的伊勢氏,其末裔伊勢貞興被義昭允許再任官職。當時足利義昭暫時以山城國本圀寺(位於今京都府京都市山科區)為居住地。永祿12年(1569年)正月,織田信長率部返回美濃、尾張時,三好三人眾趁機反撲,襲擊本圀寺(本圀寺之變)。奉公眾和明智光秀所率的織田軍奮勇抵抗,北近江的淺井長政以及攝津國的池田勝正、和田惟政等也奮戰,擊退了三好三人眾的進攻。這次事件暴露出了本圀寺守備不足的現狀,因此足利義昭命令織田信長重建了足利義輝建造的烏丸中御門第(舊二條城),以之為將軍邸。重修的烏丸中御門第新挖了兩道護城河,並翻修加高了石垣,增強了防禦機能。只有世代擔任室町幕府奉公眾的武士和高級守護大名才能進入拜見。與織田信長發生對立[編輯]另見:信長包圍網和槙島城之戰
圖片參考:
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槇島城的石標足利義昭依據當初的許諾,就任將軍之後,在10月24日給予織田信長「御父織田彈正忠(信長)殿」的尊稱,以尋求信長對幕府的支持。織田信長將義昭扶上將軍之位後,其對尾張、美濃的領有權得到了認可,並被封為和泉守護,得到昔日三好氏的領地和泉國(繁榮的堺港在該國轄下)。同時義昭對其他武將論功行賞,池田勝正被任命為攝津守護,畠山高政、三好義繼各被封為河內半國守護。織田信長被任命為管領代,其地位與管領相當;此後足利義昭又向朝廷推薦信長擔任副將軍,但被信長推辭了,改封彈正忠。然而足利義昭一心想要復興室町幕府,而織田信長則有用武力統一天下的野心,因此兩者最終關係逐漸惡化。織田信長為了限制將軍的權力,於永祿12年(1569年)正月頒布了《殿中御掟》9條,[4]並脅迫義昭承認。這使幕府將軍的行動受到了很大的制約。翌年正月又追加了5條,信長更進一步限制了幕府的權力。元龜元年(1570年)4月,織田信長討伐越前大名朝倉義景,但就在此時織田氏的同盟淺井長政與信長反目,導致信長大敗。早已對信長的專橫十分不滿的足利義昭趁機與信長決裂,元龜2年(1571年)左右向上杉輝虎(謙信)、毛利輝元、本願寺顯如、武田信玄、[5]六角義賢等大名發出御內書,下令討伐信長。這些大名加上與信長敵對的朝倉義景、淺井長政、松永久秀、三好義繼以及三好三人眾、延曆寺僧兵等勢力,形成了信長包圍網。元龜3年(1572年)10月,信長向義昭送達了17條意見狀,批評了義昭的一些舉措。[6]此時東方的武田信玄率兵進軍京都,12月22日在三方原之戰中擊破了織田信長的盟友德川家康,信長陷入窘境。足利義昭趁機任命寵臣山岡景友(六角義賢的重臣以及幕府的奉公眾)為山城半國守護。翌年正月,信長欲遣子入質於義昭以求和解,但遭義昭的拒絕。足利義昭在近江的今堅田城和石山城為幕府軍的據點,舉起反對信長的旗幟,但數日後兩城皆被攻陷。同時東方戰線的武田信玄病重,武田軍於4月開始撤回本國,12日信玄逝世。織田信長攻入京都,在知恩院佈開陣勢。幕臣細川藤孝、荒木村重等人見大勢已去,投降了信長。但是不知道武田信玄已經去世的足利義昭據守自己的居城烏丸中御門第繼續抵抗。信長再次提出和解,但義昭認為信長沒有信用,斷然拒絕。織田信長威脅幕臣以及義昭的支持者,聲稱若不投降,自己將會攻打上京並將此整個地區焚為焦土。同時包圍了義昭的居城烏丸中御門第。另一方面,織田信長尋求朝廷的支持,4月5日,在正親町天皇敕命下,雙方講和。但是足利義昭於7月3日宣佈背棄和約,在三淵藤英、伊勢貞興以及公家奉公眾的簇擁下逃往南山城的要害槇島城(山城國的守護所)舉兵。槇島城建在宇治川和巨椋池水系交叉處的島上,是足利義昭近臣真木島昭光的居城,為兵家必爭之地。烏丸中御門第的守軍於3日投降了信長,信長率7萬大軍包圍了槇島城。7月18日織田軍開始攻城,槇島城的建築被破壞,足利義昭以自己的兒子義尋為人質,向織田信長投降。