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如果論及戰後台獨運動的發展,發生於1947年的「二二八事件」絕對佔有舉足輕重的地位。二二八事件本身並沒有出現任何台獨主張,但被認爲對台灣人產生獨立想法有重大的影響。台灣人經二二八的洗禮﹐心痛惶惑之餘﹐精神領域中的『文化祖國』虛位化了﹐卻可能『創造』自己的文化認同﹔台灣人對於『國家』產生根本的迷惑了﹐然而卻也深化確定了『台灣意識』﹑『台灣人意識』﹐進而凝成動力─建造屬於自己的國家。」經過二二八事件「洗禮」的台灣人﹐確實在海外展開了台灣獨立運動。
二二八事件引來一場大整肅,許多劫後餘生的知識份子亡命海外。這些亡命海外的知識份子,在國家的追尋上,分成兩個路線發展:有的人開始尋求台灣的獨立自主,先後在日本、美歐組成台灣獨立運動的團体;另外有少部分社會主義(或共產主義)者(如謝雪紅),則投入中國大陸。
至於前者﹐隨著海外留學生的激增﹐而有相當持續的發展﹐最後與80年代台灣內部的民主運動互相呼應匯流﹐對台灣的政治演變﹐發揮了相當的影響力。而早期在島內明白揭櫫臺灣獨立的,則以1960年代彭明敏、魏廷朝、謝聰敏等人提出的「台灣人民自救宣言」最為著名。另外,在1970年以後,隨著中產階級的逐漸茁壯,被國民黨之威權體制壓抑了二十年的本島異議人士,也開始透過選舉慢慢集結起來,在民主和本土化的大旗下,和國民黨展開抗爭,這就是黨外運動以及1986年接續該運動而成立的「民主進步黨」,他們可以算是此階段後期之台獨運動的主要推動者。因此,在該段時期,國民黨將「中國共產黨」、「台獨分子」、「黨外人士」視為「三合一敵人」。
海外台灣獨立運動被稱為「海外台獨運動初期最著名的領導者」的廖文毅,於二二八事件後,雖然因為遭到通緝而亡命海外,然而,他還曾經一度在「聯邦」與「託管」之間舉旗不定,後來才標舉台灣獨立的旗幟。1960年2月,由王育德主導,幾個台灣留學生在東京成立了「台灣青年社」。另外,還有史明結合幾個團體,於1967年4月成立「台灣獨立聯合會」,次年解散,再創「獨立台灣會」。
隨著台灣留學生的在海外各地的逐漸增加,這個原本以日本為根據地的獨立運動,也慢慢擴展到美國、加拿大、以及歐洲。許多新的台獨運動團體相繼出現。進入70年代以後,分散在全球各地的部份台獨組織聯合起來,組成世界性的「台灣獨立聯盟」,並將總部設於美國。
二二八事件之後在海外興起的台灣獨立運動,出現多種不同解釋的「台灣民族論」,不過他們的共同點是,有明顯對「在台大陸人」(俗稱「外省人」)的排斥,而獨立的對象,也以在台的國民黨政府為目標。1970年代中葉,獨立運動陣營開始接受「在台大陸系人」,而產生新的觀念,認為「不管出生何地,不管何時來台,凡是認同台灣的,都是台灣人。」黃昭堂將這種台灣人觀念命名為「無差別認同論」。