He wants to have/has a pen

He wants to have a pen.

用 have 是因為之前有個'to',
to-Infinitive
infinitive 就是在'to'後面的verb(動詞)是原始的(e.g. be, go, like, etc)

所以我們唔會在上面個句到用 has!

He wants to have a pen!!
To之後係用番present tense.

He wants to have/has a pen
這是用 have 的
因為 to 後面的動詞不變
加上前面He已經使用加s的want
後面便不使用has了

2010-03-05 22:20:02 補充：
除非你話He has a pen
這裡就要使用has
即是他有一枝原子筆

希望你能明白
以及幫到你！