維吾爾人祖先是回紇 回鶻,中國古代民族名,亦稱「回紇」、「烏護」、「烏紇」、「韋紇」。回紇是唐朝早期的翻譯,而後回紇人要求更名爲「回鶻」,取其意有「鶻隼」般的勇猛。回紇是維吾爾族及裕固族等族的宗源。在唐朝的同時代,回紇和吐蕃在北方和西方立國,對中國歷史有深遠的影響。突厥語的回紇(Uighur)爲團結、同盟輔助之意,由九姓烏古斯與十姓回紇組成。而突厥汗國在突厥魯尼文中習慣稱呼回紇人做 Toquz-oghuz,意為「九姓」(見高昌回鶻條)。他們是由韋組與烏揭(烏古斯人組成的聯盟)
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土耳其人祖先是突厥
突厥的源流並未有定論,在南北朝由葉尼塞河遷居至阿爾泰山。由阿爾泰山遷居至蒙古。由蒙古前往中亞。現代土耳其人,認為自己是突厥的直系後裔,[來源請求]他們認為突厥的歷史可以追溯到西元48年立國的北匈奴。另一說法是來自鹹海一帶的戴尖幌的塞人。突厥人主要講突厥語。突厥語屬阿爾泰語系。突厥人與烏孫以狼為圖騰。大帳外置一幅狼旗。烏孫中的咄陸部與突厥人一樣,為陣亡的將士立石為記,將部落印記刻在石上。突厥最早其實只是指阿史那部,其他說突厥語的民族是鐵勒,他們與堅昆最早一起住在葉爾塞河,向後者學習冶煉。突厥一名有人說來自突厥語turka,高帽的意思。
據說有一定數目的維吾爾族認同土耳其民族,因為在維吾爾族本身的史書中,兩個民族都以匈奴汗國為先祖,維吾爾族相信匈奴汗國滅亡後,末代的匈奴單于於除鞬兩個兒子一個在極北(今天的俄羅斯外貝加爾地區),為藥葛羅家族,建立了後來的回鶻汗國,一個在金山(今天外蒙阿爾泰山)以南,為阿史那家族,建立了後來的突厥汗國。而中國各史籍中,兩個民族是分別對待的,回鶻汗國是維吾爾族的祖先;而突厥兩個汗國是土耳其民族的祖先。