光合作用(暗反應)會產生水嗎

其實兩個方程式都正確。
完整的光合作用方程式應該是這樣的﹕
6 CO2 + 12 H2O → C6H12O6 + 6 O2 + 6 H2O
也就是你列出的方程式 2.
方程式 1 只是把右邊的六個水分子跟左邊的水分子互相抵消了﹐因為反正在光合作用中產生的水分子數目比耗掉的數目少﹐所以就索性不寫。
在中學會考課程中﹐一般都會避重就輕﹐不教的那麼詳細。以下會比較詳細地解釋光反應和暗反應涉及了甚麼物質。
光反應中﹐水分子會被光能分解﹐產生氫原子﹑激活電子和氧﹐氧會離開植物﹐氫原子會被 NADP (變成了NADPH+)帶到暗反應去﹐激活電子則在葉綠素和一些電子載體之間傳送﹐釋出電子所載的能量產生 ATP以推動暗反應。
暗反應中﹐二氧化碳﹑氫原子和被送回來的電子 (不再是激活電子﹐因為能量已經被消耗了) 發生一系列稱為卡爾文循環的反應 (NADPH+變回NADP)﹐產生碳水化合物和水分子﹐過程由光反應中所產生的ATP所推動。

Yes