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南ㄋㄢˊ謨ㄇㄛˊ
就是皈依、皈命的意思，平時大多譯成「南無」，南謨、南無都是音譯，表示虔誠地皈投依止。
薄ㄅㄛˊ伽ㄑㄧㄝˊ伐ㄈㄚˊ帝ㄉㄧˋ即薄伽梵，也就是世尊。
鞞ㄆㄧˊ殺ㄕㄚ社ㄕㄜˋ寠ㄐㄩˋ嚕ㄌㄨˇ 是藥師之意。
薜ㄅㄧˋ琉ㄌㄧㄡˊ璃ㄌㄧˊ 就是琉璃。
跋ㄅㄚˊ喇ㄌㄚˋ婆ㄆㄛˊ是光、光明的意思。
喝ㄏㄜ囉ㄌㄚˋ闍ㄕㄜˊ也ㄧㄝˇ就是王。
怛ㄉㄚˊ他ㄊㄚ揭ㄐㄧㄝ多ㄉㄨㄛ耶ㄧㄝ 是如來。
阿ㄚ囉ㄌㄚˋ喝ㄏㄜ帝ㄉㄧˋ是應供的意思。
三ㄙㄢ藐ㄇㄧㄠˇ三ㄙㄢ勃ㄅㄛˊ陀ㄊㄨㄛˊ耶ㄧㄝ
就是正等覺。
（綜合起來就是「皈命世尊藥師琉璃光王如來、應、正等覺」）
怛ㄉㄚˊ姪ㄓˊ他ㄊㄚ 是「即說咒曰」之意。
唵ㄨㄥˋ 是佛經咒語的發聲字，具有警惕的意味。
鞞ㄆㄧˊ殺ㄕㄚ逝ㄕˋ 鞞ㄆㄧˊ殺ㄕㄚ逝ㄕˋ 鞞ㄆㄧˊ殺ㄕㄚ社ㄕㄜˋ 就是藥、藥、藥。
三ㄙㄢ沒ㄇㄛˋ揭ㄐㄧㄝ帝ㄉㄧˋ
即是普渡──普遍地救度一切眾生。
娑ㄙㄨㄛ訶ㄏㄜ。 亦作娑婆訶，意思是速成就。
眾生的心病需要良藥醫治，而最好的心藥就是專心，去除雜念。稱念佛名或持咒的功用就在此。這段藥師神咒，完全是針對眾生身體上的病痛，及內心的惶恐，希望眾生能虔誠的持名、持咒，以求身心解脫自在，能夠圓滿成就。
以上節錄自證嚴法師「東方琉璃藥師佛大願──
＜藥師經講記＞」下集426~428頁。
也有人只持念「藥師心咒」，
唵 鞞殺逝 鞞殺逝 鞞殺社 三沒揭帝 娑訶。
這算是簡化版，是全段咒語的後半段。只要專心持念藥師佛名，自可消災延壽，所求願滿。
世尊、藥師琉璃光王、如來、應、正等覺。是佛的十種稱名之一，藥師經一開始提到藥師佛時就有說到十種名稱「如來、應、正等覺、明行圓滿、善逝世間解、無上士、調御丈夫、天人師、佛、薄伽梵」。出自回答者(我要買SEED)。
2007-10-25 08:21:52 補充：
阿彌陀佛！大德你好：
末學平日是以地藏經為主，身體病痛時會加上藥師咒水，自己也曾持過１０８次藥師水喝，確實有效。因此在此建議你！可以告知友人在探病當時，取藥師水抹在小孩嘴邊(若無法喝),也可擦在身體。有時間的話，可以留在加護病房外持咒，對小孩助益更大，儀式可不拘束，只要持咒前對佛像恭敬禮拜即可，若無，至誠恭敬持咒。
南無地藏菩薩摩訶薩 為佛弟子合十
2007-10-25 08:29:01 補充：
另外，如果你友人不排斥的話，可以建議他每天持念地藏經回向他的小孩累世之冤親債主（若覺得太多，可以一天念一品，或是卷上、卷中、卷下分三天念，不會因為沒有馬上念完整部就沒幫助）。要讓他了解，地藏菩薩不是鬼王，不是陰神，他是等覺果位菩薩，已有佛之悲智與證果。
地藏經裡面第八品有提到這方面的方法，建議你去看看了解。
