一國兩制的壞處

部分臺灣民眾和黨派認為臺灣和大陸分別是兩個主權獨立的國家。
江澤民的「一個中國，就是中華人民共和國」，再加上香港幾次民主街頭抗爭，尤其是香港居民多次抗議《香港基本法》第二十三條立法之後，臺灣地區不少人對「一國兩制」或「五十年不變」的承諾更見保留。
香港在董建華特首的領導之下，比照中國內地，拒絕部分法輪功學員及中國民運人士入境，在政治氛圍上愈來愈與北京趨近，也讓不少臺灣民眾質疑一國兩制的可行性；
在2004年4月26日人大釋法後，有一部分香港議員認為一國兩制在政治實際上已經名存實亡。而多數臺灣民眾也反對將資本主義與西方式民主制度脫勾，即無法容忍只有經濟、商業上的一國兩制。
泛藍政論家趙少康曾批評一國兩制中台灣可以有自主軍隊，可是武器採購必須由中國負責的作法，認為「到時候部隊一人發一支水槍」，軍力有等於無。

總的來說，在大陸方面，一國兩制的觀點在中國共產黨的大力宣傳下深入人心並受到廣泛擁護，但中國共產黨顯然對民眾迴避了一國兩制很多爭議和負面因素。 在港澳，一國兩制存在相當爭議，但大多數立法會議員和特區政府官員均擁護一國兩制。當然也有部分民眾和政治人物質疑前者是否能夠真正代表香港市民。 而在臺灣，根據2004年台灣陸委會委託台灣政治大學選舉研究中心進行的例行性民意調查結果顯示，在台灣有超過八成的受訪者反對一國兩制(80.8%)，僅有不到一成的受訪者表示贊成(8.3%)。在同一份調查中另外顯示，84%的民眾主張廣義的維持現狀，看情況再決定獨立或是統一。據「陸委會」提供的資料，臺灣民眾贊成「一國兩制」比例最高是在2001年3月調查時的16.1%。臺灣知名人士李敖一直旗幟鮮明的支持一國兩制。

一國兩制的壞處
１．政治被操控；
２．軍事無實權；
３．兩地人民互相歧視；（例子，被人稱港燦。）
４．教育醫療不配合；（例子，你可唔可以用國內學歷見工，你可唔可以到國內拿病假紙。）
５．道德和價值觀未能認同；（例子，你會唔會在香港食肆吸煙呀！）

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