大陸居民...入境台灣手續及申請需時？

想請問...如大陸居民因工作關係想到台灣一趟，除台灣工作單位向台灣入境處辦理申請入境証外，大陸居民在國內需向那個單位申請？手續如何？需時多久？
另，如台灣批出入境証後，大陸居民要否持有中國護照才能入台灣？通常國內居民申請中國護照需時多久？急，有勞各位指點！