第1話 穿越時空的少女與被封印的少年
身為擁有多年歷史的日暮神社家的女兒~日暮籬,在15 歲當天意外地被妖怪拉進「食骨之井」,穿越了時空進入古代的戰國時代。在那裡她與宿命的冤家,一個由妖怪與人類結合所生的半妖少年---犬夜叉相遇,並無意間解開了犬夜叉身上的封印使其復活。
第2話 奪取四魂之玉的妖怪
擁有無限妖力的「四魂之玉」原本藏在日暮籬的體內,在一次與妖怪的爭奪戰裡,「四魂之玉」破碎開來分散於各地,阿籬與犬夜叉兩人因而踏上蒐集碎片之旅,並在冒險的旅程中,陸續發生了許多事……。
第3話 從食骨之井回到現代
雖然楓姥姥告訴阿籬和犬夜叉兩人必須同心協力,才能找回散落各處的四魂之玉碎片,但是不合的兩人,加上一心想回到現代,尋找散落的四魂之玉,更加困難。偏偏這時候出現了一個操縱頭髮的妖魔,她把阿籬推進了食骨之井……。
第4話 逆髮妖魔,結羅
原本以為回到現代就能安心度日的阿籬,卻在吃飯時看到犬夜叉闖了進來,更可怕的是犬夜叉還引來了逆髮結羅操縱的頭髮,阿籬為了保護家人決定再跟犬夜叉回到古代與逆髮結羅對決……
第5話 戰慄的貴公子殺生丸
犬夜叉的哥哥殺生丸與他的手下邪見突然出現,他一心想尋找父親墓地裡的寶物,令守墓人冥加爺爺十萬火急地趕來通知犬夜叉。沒想到殺生丸隨即找上門,而且還帶來一個與犬夜叉的母親十分神似的女人……
第6話 陰森森的妖刀鐵碎牙
原來殺生丸帶來的犬夜叉母親是妖怪無女,她是失去孩子的母親怨念聚集而成的妖怪,殺生丸利用無女問出了父親墓地的線索,兩人便在墓地中展開了一場寶物爭奪戰……
第7話 激烈對決!殺生丸VS鐵碎牙
殺生丸與犬夜叉都無法拔出來的鐵碎牙,沒想到阿籬竟然輕而易舉地拔出來。不過問題是犬夜叉卻不懂得如何發揮鐵碎牙的威力,還把它認為是一把破破爛爛的刀子。直到犬夜叉決心要保護阿籬時,這把鐵碎牙竟然產生了脈動……
第8話 妖怪殿下九九蟾蜍
犬夜叉與阿籬這次遇到了一個自稱是信長的人,不過他可不是歷史上的大人物織田信長,而這個信長是為了救出心愛的露姬公主,來到一座被蛤蟆精占據的城裡。雖然最後順利消滅了蛤蟆精也救出了公主,公主卻投向別人的懷抱……
第9話 七寶登場!雷獸兄弟,飛天滿天
突然出現的可愛妖怪七寶,目的竟然也是四魂之玉的碎片,不過他是為了利用四魂之玉引出殺父仇人雷獸兄弟(飛天與滿天)。阿籬為了救七寶被滿天抓走了,七寶也只好急著找犬夜叉去救阿籬,沒想到飛天的雷擊刃非常厲害……
第10話 「妖刀激戰!雷擊刃VS鐵碎刀」
雖然犬夜叉及時趕到,卻因為雷獸兄弟擁有四魂之玉的碎片而妖力大增,也只能與飛天陷入苦戰。另一方面阿籬與七寶也還在滿天的威脅之下,幸好犬夜叉的鐵碎牙先解決掉滿天,不過卻……
第11話 在現代復活的咀咒面具
阿籬趕回現代準備參加學校的考試,沒想到神社突然失火了,原本被封印的面具又復活了。阿籬為了救弟弟草太,用四魂之玉碎片引開面具,然後要草太去古井找犬夜叉過來除妖,然而犬夜叉對先前的事還懷恨在心……
第12話 崇妖童靈與小小惡靈
回到現代的阿籬陪著弟弟草太到醫院看同學,而這個同學阿悟家裡在半年前發生火災,從此昏迷不醒。阿籬更意外地發現阿悟已死去的姐姐真由竟然不斷出現在他們面前,並且一直想害死阿悟。變成惡靈的真由就要被"崇妖"帶入地獄……
第13話 新月之謎,黑髮的犬夜叉
阿籬為了回到戰國時代與犬夜叉一起去尋找"四魂之玉"碎片,不得不再次告別現代的學生生活。沒想到一到戰國的她又遇上了可怕的蜘蛛頭妖怪,更糟的是犬夜叉竟然會在新月之夜喪失所有的妖力,他們該如何對抗蜘蛛頭呢?
第14話 桔梗的靈骨被竊走了
犬夜叉在旅途中,聞到裡陶有著楓姥姥的血腥味,於是他們一行人匆匆趕回村子裡,沒想到有人盜了桔梗的骨灰。原來是裡陶想利用桔梗的骨灰來幫她搶到"四魂之玉"碎片,然而由於桔梗的靈魂已經轉世,她創造出來的只是一個空殼……
第15話 悲運的巫女,桔梗復活
桔梗的復活讓犬夜叉感到十分震驚,原本以為她將成為鬼婆裡陶使喚的工具,沒想到桔梗擁有自我意識,但是她的意識竟然是對犬夜叉強烈的恨意。原來當年犬夜叉與桔梗都認為是對方背叛了自己,而這個謎隨著桔梗的死更變得無解…
第16話 右手風穴,不良法師彌勒
搶走阿籬身上四魂之玉碎片的彌勒法師與犬夜叉對上了!兩人在打鬥中,彌勒將纏繞在右手上的念珠取下,他的右手上有個能將所有東西吸進去的風穴。在千鈞一髮之際,阿籬撲倒了彌勒化解了一場危機。原來他右手的風穴是受到奈落的詛咒,而這個奈落竟然是50年前把守護四魂之玉的桔梗殺死的兇手……
第17話 地獄畫師骯髒的墨
原來彌勒法師與阿籬他們有著相同的目的,都是想要尋找四魂之玉碎片,卻因為犬夜叉與彌勒之間的競爭心理而相處的不太好。這次遇到了可以讓墨畫裡的妖魔鬼怪現形的畫師,兩人同心協力擊倒他,並且又找到一片四魂之玉碎片。
第18話 奈落與殺生丸聯手出擊
殺生丸的手臂在上次與犬夜叉交手時,被犬夜叉用鐵碎牙砍斷了,因此殺生丸一直再尋找強而有力的手臂代替。奈落拿出一隻鑲有四魂之玉碎片的人類手臂給殺生丸,並且準備了毒蟲之巢對付彌勒的風穴。得到奈落幫助的殺生丸果然搶到了鐵碎牙……
第19話 回去吧,阿籬!回到妳的時代
由於鐵碎牙被殺生丸搶走,讓犬夜叉陷入了苦戰,阿籬為了救大家拿出弓箭對付殺生丸,卻反而被殺生丸傷到。犬夜叉犧牲自己的身體,扯下殺生丸的假手搶回了鐵碎牙,讓殺生丸知難而退。然而他們都知道背後還有一個更可怕的敵人奈落,害怕失去阿籬的犬夜叉決定逼阿籬回到現代……
第20話 卑鄙的野盜,鬼蜘蛛之謎
身受重傷的犬夜叉為了怕阿籬遭到奈落的毒手,把她推回了現代世界。奈落知道犬夜叉受了重傷,就利用四魂之玉碎片的力量控制狼野干來攻擊他們。原本楓姥姥與彌勒為了保護犬夜叉把他封印起來,沒想到犬夜叉最後還是出來與狼野干決戰……
第21話 揭開奈落的真面目!桔梗的靈魂,上集
擁有四魂之玉碎片力量的狼野干,讓傷勢還沒恢復的犬夜叉陷入生死苦戰。心繫犬夜叉的阿籬陰錯陽差地回到了戰國時代,她的出現果然讓犬夜叉發揮力量擊敗狼野干,他們也看到奈落的真面目……
第22話 揭開奈落的真面目!桔梗的靈魂,下集
犬夜叉與阿籬他們原本只是想找個地方投宿,沒想到卻意外發現這裡有專門抓亡魂的妖怪,更令人意外的是在背後操縱的竟然是桔梗。原來桔梗並沒有死,隱姓埋名待在一個村子裡生活,不過由於一位法師的出現讓她不得不再次離開…
第23話 阿籬的聲音與桔梗的親吻
阿籬輕易突破桔梗設下的結界,看到了沈睡的桔梗,在桔梗面前的她竟然無法動彈。接下來犬夜叉出現了,卻看不到阿籬也聽不到她的聲音。桔梗為了自私的愛想拖犬夜叉一起下地獄,幸好阿籬喚醒了犬夜叉。而犬夜叉究竟會選擇誰呢?
第24話 神奇驅魔師,珊瑚登場
犬夜叉一行人聽說有個驅魔師的女孩(珊瑚)也在收集四魂之玉碎片,於是他們急於找到驅魔師村子。沒想到他們晚來一步,因為珊瑚他們被騙到城裡收妖,所有的同伴包括珊瑚的父親及弟弟都因此喪命,他們的村子也遭到妖怪攻擊,所有人都死了,悲憤的珊瑚竟然以為這一切都是犬夜叉所為…
第25話 破解奈落的詭計
被奈落欺騙的珊瑚果然找到犬夜叉,並且向他報仇。打鬥中,明明已經身受重傷的她,卻突然增強了功力,原來是奈落在她背後鑲上了四魂之玉碎片。幸好冥加及雲母的存在讓珊瑚開始懷疑奈落,最後終於揭穿了奈落的詭計…
第26話 終於揭開四魂之玉之謎
珊瑚在知道真相後終於接受了犬夜叉一行人,於是帶他們來到鐘乳洞穴,並且在這裡向大家說出四魂之玉的由來以及當年英勇對抗妖怪們的巫女-翠子的故事。原來四魂之玉之所以會忽善忽惡,是因為翠子與妖怪的靈魂還在四魂之玉裡戰鬥…
第27話 水神支配的黑暗湖
一行人為了找尋奈落的下落,來到一個剛淹過大水的村子,正巧看到他們要送活人祭品獻給水神,然而奇怪的是原本被選上當作祭品的城主兒子卻出現在他們面前,並且要雇用他們一起去打擊作惡多端的假水神…
第28話 陷入殘酷陷阱的彌勒
阿籬他們從一大早就沒有看到彌勒法師,聽冥加爺爺說昨晚看到彌勒一直看著自己的右手風穴,而且又看到那群毒蜂出現了,原來是奈落的陷阱而彌勒帶著右手風穴的傷,被上百隻的小妖怪包圍了,生命危在旦夕…
第29話 珊瑚的苦惱與琥珀的命運
驅魔師珊瑚有個叫做琥珀的弟弟,卻因為掉入奈落的陷阱喪失了性命,珊瑚背上的傷痕讓她不斷想起弟弟,沒想到出現在面前的殺人兇手竟然就是琥珀,原本是奈落利用"四魂之玉碎片"讓琥珀復活逼珊瑚幫他搶走的鐵碎牙…
第30話 被奪走的鐵碎牙決戰奈落城堡
奈落竟然用弟弟琥珀的性命,威脅珊瑚偷走犬夜叉的鐵碎牙,而且奈落還命令琥珀對珊瑚動手,只是他沒想到珊瑚寧可犧牲性命也要保護弟弟,鐵碎牙,讓大家陷入奈落的瘴氣之中無計可施…
第31話 心地善良卻悲哀的地念兒
阿籬聽說有種藥草可以治療雲母中的毒於是他們出發尋找那個藥草田,不料遇到一個身材魁梧的妖怪(地念兒),不過雖然他看起來力氣很大也很嚇人眼神卻十分溫柔,村裡的人也都誤會他了,甚至想置他於死地…