FAT與NTFS的分別

NTFS is the file system of Windows NT & the following Windows. Only Windows can read and write it. Other OSs can't read it or just can read it.
FAT(can't support files bigger than 4GB) is the old file system, so all OSs can read and write it.
The above is writen by me

The below is copy from
http://www.microsoft.com/taiwan/technet/archive/ittasks/deploy/fat.aspx
安全性

我們之前已提過 NTFS 有一個內建的安全系統。您可以授與各種使用權限給目錄及個別的檔案。這些權限可以在本機及遠端保護橎案及目錄。例如，如果有人使用含有受保護檔案的 PC 時，NTFS 可以保護這些檔案。

如果您使用 FAT，則是依賴共用使用權限的安全性。共用使用權限可以保護網路上的檔案，但不提供本機保護。嘗試存取受保護檔案的人可以很容易地使用本機 PC 來取得這些檔案的完整存取權限。共用使用權限的另一項缺點是難以管理。假設您的伺服器上有數以百計的使用者，每一位使用者各有其自己的目錄。結果可能有數百個共用項目，其中有些互相重疊，而增加了複雜程度。

2006-10-15 18:30:29 補充：
那就冇問題la，兩個都得不過，我都講過，FAT這個file system不可以support over 4GB的(單一)檔案，如果你燒DVD嘅，一個iso都有4.幾GB